NIS-Elements 是由尼康開發而成的一種一體化成像軟件平臺，它可對顯微鏡圖像拍攝以及文檔數據管理實現控制。NIS-Elements可處理多維成像任務，同時支持六維圖像的捕獲、顯示、周邊設備控制以及數據管理和分析。
NIS-Elements成像軟件產品系列包括三種各不相同的軟件包，您可以根據您的用途或應用選擇合適的軟件包。

NIS-Elements D 使用基本測量和功能支持生物研究、和工業應用中的彩色文檔管理需求。
NIS-Elements BR 適合進行標準研究應用。它具有通過4D（可以從X、Y、Z、時間、波長、位點等六個維度中多選擇4個維度）圖像獲取和設備的控制功能。
NIS-Elements AR 針對研究應用進行優化，它具有通過6D（X、Y、Z、時間、波長、位點）圖像獲取和分析全自動獲取和設備控制的功能。

強大的功能

一：硬件控制：

可以控制尼康電動顯微鏡的電動部件，實現操作鼠標化（當然鼠標的控制功能也可以解除）。CCD的圖像捕獲任務與電動部件的匹配。除此之外，第三方的電動部件如電動調焦機構、掃描頭、濾光片轉輪以及CCD相機也可以控制（有的硬件需另外增加插件模塊）。

二：多維圖像的捕獲、存檔、顯示：
　 1. 三維圖像：Z軸XY掃描（XY+Z）、記錄（XY+T）、多色熒光（XY+波長）都是三維圖像捕獲的典型例子，這些功能對于NIS-Elements軟件來說只是很容易實現的功能。
2. NIS-Elements軟件可以將這六維參量同時測量并捕獲圖像。并具以ND2文檔格式將六維捕獲圖像保存在一個文件中。
3.多維圖像的顯示：NIS-Elements可以將六維圖像分解成各個維度進行顯示。
4.多點捕獲的圖像還可以完成無縫隙拼接。

三：圖像處理、分割、測量、分析：

NIS-Elements提供了一個LUT，無論是實時圖像顯示還是從外存貯器讀出的圖像文檔，LUT都可以進行RGB或都灰度、對比度等參數進行調節，從而使圖像銳度、色調、對比度均處于狀態，便于我們進行圖像的識別分割，以進行進一步的測量和分析。
圖像分割：可進行灰度分割和彩色分割。可以自動分割，也可以手動點取目標（手動點取目標時，NIS同樣賦于智能目標邊界識別功能）。
測量：NIS提供了手動交互測量和自測量兩種方式，可以將目標的形態參數以及光密度參數測量（當然需要預選定標）。
分析：測量所得數據可以進行篩選和分類分析，數據可以輸出到電子表格中，也可以繪制成各種圖表（直方圖、餅圖等）。

四：生成：
Report Generator（生成器）允許用戶定制圖文，其中包含圖像、數據庫參數、測量數據、用戶輸入文本、圖表等。
NIS能夠將文件輸出到PDF文檔格式。

五：圖形數據庫管理功能（插件）：
NIS-Elements具有一個大的圖像數據庫模塊，它支持圖像和數據元。可以在其中輕松創建各種數據庫和表，并且可以通過鼠標單擊將圖像保存到數據庫。根據給每個圖像分配的數據庫字段還可以篩選、排序和多次分組。


六： 新型設計

1：多層文檔結構：

每一個文件（圖像）都包含一個三層數據結構（批注信息、二進制信息、色彩信息）。因而適合于分析用。多層結構圖通過JPEG2000/ ND2/LIM文件格式保存。

NIS-Elements軟件可以識別JPEG2000，ND2，TIFF，JFF，JPG，BMP，LIM。ICS、IDS結構的圖形文件。其中ND2允許在ND2圖像實驗中進行圖像排列。同時包含了硬件設置信息。

2:圖像管理布局器：

圖像管理器布局方便于圖像文件和數據庫的處理。此外，它還有許多方便的特性。點擊NIS-Elements窗口中右上角的Organizer Layout按鍵或者按下F10將啟動Organizer Layout。

整個窗口主要由兩個相同的面板組成。每一個面板可以變換兩種模式：文件模式和數據庫模式。從視圖菜單中點擊"Next Pane"可以在兩塊面板中進行切換。要從其中一塊面板中向另一塊面板中復制文件直接將選中文件拖至另一面板即可。

3:功能插件模塊

圖像數據庫管理模塊：
NIS-Elements有一個大的內部數據庫管理軟件。數據庫支持圖像和元數據，允許用戶生成模板或直接打印和PDF化。可以方便地建立數據和編輯表。
此外，濾鏡、排序和多重分組都可以通過圖形用戶界面的拖放功能實現。

EDF景深擴展模塊：
通過電動或手動聚焦，NIS可以獲取Z軸序列圖，并將Z軸序列圖整合成共焦點圖像，生成立體視視覺效果和三維表面效果圖。

用NIS-Elements搭建成的顯微鏡成像系統

（1）基本成像分析系統
構成：
相機：尼康DS-Fi1/DXM1200c；
顯微鏡：尼康50i/80i/TE2000S/U
軟件：NIS-Elements BR
可以實現的功能：
–1）拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入圖像；
–2）形態學的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
–3）自動/手動拼圖

（2）4維成像分析系統
構成：
相機：尼康DS-Fi1/DXM1200c；
顯微鏡：尼康50i/80i/TE2000S/U
軟件：NIS-Elements BR　+　4D Imaging
可以實現的功能：
– 1）拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入以及4維圖像；
– 2）形態學的全自動測量/半自動測量/交互式測量；
– 3）自動/手動拼圖
– 4）圖文

（3）6維成像分析系統
構成：
相機：尼康DS-5Mc/DXM1200c；
顯微鏡：尼康90i/TE2000E　+ Auto Stage
軟件：NIS-Elements AR　+　6D Imaging
可以實現的功能：
– 1）拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入以及4到6維圖像；
– 2）形態學的全自動測量/半自動測量/交互式測量；
– 3）自動/手動拼圖
– 4）圖文

（4）活細胞成像分析系統
構成：
相機：尼康DS-2Wc；
顯微鏡：尼康TE2000E　
軟件：NIS-Elements BR　+　 Time Measurement
可以實現的功能：
– 1）拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入；
– 2）形態學的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3）熒光動態測量，Ratio測量；
– 4) 時間間隔拍攝（Timelapse）
– 5）自動/手動拼圖
– 6）圖文

（5）活細胞成像分析系統
構成：
相機：Roper Coolsnap HQ2
顯微鏡：尼康TE2000-PFS　
軟件：NIS-Elements BR　+　 Time Measurement
可以實現的功能：
– 1）拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入；
– 2）形態學的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3）熒光動態測量，Ratio測量；
– 4) 時間間隔拍攝（Timelapse）
– 5）長時間拍攝時，避免焦點漂移；
– 6）自動/手動拼圖
– 7）圖文

（6）厚標本成像分析系統
構成：
相機：尼康 DS-Fi1/DXM1200c
顯微鏡：尼康90i/80i/SMZ　
軟件：NIS-Elements BR　+　 EDF
可以實現的功能：
– 1）拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入；
– 2）形態學的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3）實時景深擴展功能，觀察厚標本；
– 4）自動/手動拼圖

（7）“數字共聚焦”系統
構成：
相機：尼康 DXM1200c/Roper Coolsnap HQ2
顯微鏡：尼康90i/TE2000E
軟件：NIS-Elements AR　+　 3D Deconvolution
可以實現的功能：
– 1）拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入；
– 2）形態學的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3）3D去模糊；
– 4）拼圖